Six Transmembrane K-channels

Gene Accession Tissues ESTs tissue BAC,PAC exons chromosome sts Sanger
SHAKER-FAMILY-I                  
DroShaker M17211                
hydra U32922                
Aplysia M95914                
Squid U50543                
Schistosoma L26968                
Paramecium AF035271                
  AF035270                
  U19907                
  AF035273                
Kv1.1 KCNA1                
hum.Kv1.1 L02750 brain AA057369 retina AC006063   12p13.3    
      AA018118 retina          
      AA018214 retina          
      H18086 brain          
      H41110 brain          
      AA018120 retina          
ratKv1.1 X12589 brain              
  M26161 brain              
mouKv1.1 M30439 brain     M36456 exon-CDS      
  Y00305 brain              
  U05750 brain              
rabKv1.1 M81354 kidney              
  M81353 kidney              
  M81350 kidney              
XenKv1.1 M94258 neuron              
Kv1.2 KCNA2                
humKv1.2 L02752 brain              
ratKv1.2 X16003 brain              
  J04731 brain              
  M74449 heart              
mouKv1.2         M30440 exon-CDS      
rabKv1.2 M81351 kidney              
  S73585 kidney              
  M81352                
BovKv1.2 X66185 brain              
  L23170 brain              
DogKv1.2 L19740 colon SM              
XenKv1.2 M35664 neuron              
Kv1.3 KCNA3                
humKv1.3 M38217 genomic AI095381 fibroblast     1p21-13.3 G11354  
  X57342 genomic AA811374 tonsil          
  M85217 T-cells              
  L23499 T-cells              
  M55515 genomic              
ratKv1.3 X16001 brain              
  M30312 T-cells              
  M31774 brain              
mouKv1.3 M30441 genomic AI323235 thymus          
      AA119270 thymus          
rabKv1.3 U38240 kidney              
chickKv1.3 U62142 cochlea              
Kv1.4 KCNA4                
humKv1.4 M55514 Skl. Mus         11p14.3-15.2 G11332  
  M60450 cardiac           G13430  
  L02751 brain              
ratKv1.4 X16002 brain              
  M32867 heart              
mouKv1.4 U03723 genomic              
ferKv1.4 U06156 heart              
bovKv1.4 X57033 adr. Med              
rabKv1.4 L01789 kidney              
ChiKv1.4 U82365 cochlea              
Kv1.5 KCNA5                
humKv1.5 M60451 cardiac AA220960 brain AC005906   12p13.3 G06449  
  M83254 cardiac              
  M55513 insulinoma              
ratKv1.5 M27158 genomic              
  M31745 genomic              
  M37145 genomic              
mouKv1.5 AF108659 cardiac              
  L22218 cardiac              
rabKv1.5 AF056943 portal vein              
  D45025 cardiac              
ferKv1.5 U45979 atria              
dogKv1.5 U08596 Smt. Mus              
Kv1.6 KCNA6                
humKv1.6 X17622 brain T08895 infant brain AC005833   12p13.3 G43250  
      T28887 brain          
      Z42231 brain          
      R15156 infant brain          
mouKv1.6 M96688 brain              
ratKv1.6 X17621 brain              
  M27159 brain              
  M31746 brain              
  M37146 brain              
Kv1.7 KCNA7                
humKv1.7             19q13.3    
mouKv1.7 AF032099 genomic AI322534 placenta          
  AF032101 genomic AI324179 placenta          
  AF032100 genomic AA021711 placenta          
      AI323497 NG108          
SHAB-FAMILY-TWO                  
DroShab M32659 brain              
                   
Kv2.1 KCNB1                
humKv2.1 X68302 genomic AA166676 brain     20q13.2   dJ791K14
  AF026005 lens epith. AA625212 ?          
  L02840 cortex AA108285 cochlea          
      AA013066 retina          
      L49073 retinal fovea          
      L49103 retinal fovea          
      L49112 retinal fovea          
      R85006 brain          
pigKv2.1 AF026006 lens epith.              
mouKv2.1 M64228 brain              
ratKv2.1 X16476 brain              
XenKv2.1 U20343 neurons              
AplyKv2.1 S68356 bag neurons              
LeechKv2.1 AF082190 leech              
  AF039834 leech              
Kv2.2 KCNB2                
humKv2.2 KCNB2                
ratKv2.2 U69962 ?              
dogKv2.2 M77482 brain              
XenKv2.2 U69963 ?              
  U20342 spinal neu              
SHAW_FAMILY THREE                  
DroShaw M32661 brain              
Aplysia AB001339                
Kv3.1 KCNC1                
humKv3.1 S56770 brain AI201688 brain AC004736   11p14.3-15.2    
  L00621 brain H19662 brain          
  M96747 T-cells H50388 brain          
mouKv3.1 Y07521 NG108 AA097374 NG108          
      AI323497 NG108          
      AA497891 NG108          
      W09980 total fetus          
      W85433 NG108          
      AI323145 NG108          
      AA051436 NG108          
      AI324233 NG108          
ratKv3.1 X62840 brain              
  M68880 brain              
chickKv3.1 Y07589 fibroblast              
Kv3.2 KCNC2                
humKv3.2     H49142 brain          
ratKv3.2 M34052 brain AI007694 brain          
  M69011 brain AI363404 brain          
  M84203 CNS              
  M59211 brain              
  M84202 brain              
  X62839 brain              
  M59313 brain              
mouKv3.2 U52223 insulinoma              
Kv3.3 KCNC3           19q13.3    
humKv3.3 AF055989 lens epith              
  Z11585 genomic              
ratKv3.3 M84210 pheochromo AI144642 brain          
mouKv3.3 S69381 cerebellum              
  X60797 genomic              
  X60796 genomic              
Kv3.4 KCNC4                
humKv3.4 M64676 brain stem AA400462 ?     1p21    
      AA627053 prostate          
      AA781718 parathyroid          
      AA860738 parathyroid          
ratKv3.4 X62841 brain         3    
mouKv3.4 M81253 genomic     AJ010307 exon 1      
          AJ010309 exon 3      
          AJ010310 exon 4      
SHAL-FAMILY FOUR M32660 brain              
DroShal U78642                
Hydra L49135 neuron              
lobster                  
Kv4.1 KCND1                
humKv4.1 AJ005898 brain AI150825 fetal heart     Xp11.23    
      R19492 fetal brain          
      F05846 brain          
      F07466 infant brain          
      R16330 infant brain          
      Z44902 infant brain          
      R61454 infant brain          
      Z40519 infant brain          
      F03868 infant brain          
      T35424 colon          
mouKv4.1 M64226 brain              
Kv4.2 KCND2                
humKv4.2     AA430701 ovary AC004946   7q31    
ratKv4.2 M59980 heart     AC004888        
  S64320 hippocampus              
Kv4.3 KCND3                
humKv4.3 AF048712 heart AI369146 brain     1p13   dJ773A18
  AF048713 heart              
ratKv4.3 L48619 hippocampus              
  U42975 heart,brain              
  U75448 ventricle              
  M74898 pheochromo              
  U92897 heart              
  AB003587 smth. Mus              
dogKv4.3 AF049887 atrium              
FAMILY-FIVE                  
Aplysia L35766                
                   
Kv5.1 KCNF1                
humKv5.1 AF033382 brain AA984726 brain     20q13?    
      R21482 infant brain          
      F05186 infant brain          
      R24800 infant brain          
      R20083 infant brain          
      H22867 infant brain          
ratKv5.1 M81783                
FAMILY-SIX                  
Kv6.1 KCNG1                
hKv6.1 AF033383 brain AA148718 uterus     2p25?    
      AA193556 uterus          
rKv6.1 M81784 brain AI237056 ovary          
      AI407741 ovary          
chickKv6.1 U62139 cochlea              
mKv6.1     AA433531 heart          
      AA591524 blastocyst          
FAMILY-EIGHT                  
Kv8.1                  
hKv8.1     U69191 infant brain     8q22.3-22.4    
      H11972 infant brain          
      T74525 infant brain          
      F12562 infant brain          
ratKv8.1 X98564 brain              
hamKv8.1 U62810 beta cells              
mouKv8.1     AA387130 embryo          
FAMILY-NINE                  
Kv9.1 KCNS1                
humKv9.1 AF043473 lens epith H49759 brain Z93016   20q12-13.2   dJ211D12
      H18164 brain         dJ172H20
      H20365 brain          
      H51390 brain          
      H85737 brain          
      H42586 brain          
      H49525 brain          
      H18119 brain          
      H43171 brain          
      H85454 melanocyte          
      H99478 melanocyte          
      H43697 brain          
      H51391 brain          
      H20175 brain          
      AA788916 frontal cortex          
      T08732 infant brain          
      H43779 brain          
      R88616 brain          
      R87913 brain          
ratKv9.1 Y17606 brain              
mouKv9.1 AF008573 brain              
Kv9.2 KCNS2                
humKv9.2     U69192 infant brain     8q22    
      R19352 infant brain          
      H19264 brain          
      R34920 infant brain          
mouKv9.2 AF008574                
Kv9.3 KCNS3                
humKv9.3 AF043472 lens epith.         2p24    
ratKv9.3 Y17607 brain              
  AF029056 brain              
mouKv9.3     AA562860 blastocyst          
      AA537251 blastocyst          
FAMILY-TEN   KCNQ              
KCNQ1 KLQT1                
hKvLQT1 U89364 genomic     AC005950   11p15.5    
  U40990 genomic     AC001228        
  U71077 genomic     U90582        
  AF000571 kid, heart     AC002403        
  AF051426 heart     AC000377        
  U86146 heart     AC003675        
  AF003743 heart     AC003693        
          U90095        
          AB015147        
          AB015148 exon-1      
          AB015150 exon-1a      
          AB015151 exon-2      
          AB015152 exon-3      
          AB015153 exon-4      
          AB015154 exon-5      
          AB015155 exon-6      
          AB015156 exon-7      
          AB015157 exon-8      
          AB015158 exon-9      
          AB015159 exon-10      
          AB015160 exon-11      
          AB015161 exon-12      
          AB015162 exon-13      
          AB015163 exon-14      
            exon-15      
mKvLQT1 U70068 heart     AJ002199 exon-1-b      
          AJ002200 exon-1-g      
          AJ002201 exon-1-d      
          AJ002202 exon-1-e      
rKvLQT1 U92655 ventricle              
catKvLQT1 AF013961 heart              
PigKvLQT1 AF049341 heart              
XKvLQT1 U71076 oocyte              
dogfishLQT AJ223714 rectum              
KCNQ2                  
hKCNQ2 AF074247 neuronal AA922137 lung,testis     20q13.3    
  D82346 neuroblastoma AA812513 testis          
  Y15065 brain T15380 brain          
  AF033348 brain H23702 brain          
      H51419 brain          
      H23701 brain          
      AA091374 fetal heart          
      AA865472 fetal heart          
      T03719 infant brain          
      H51461 brain          
      AA993624 testis          
      AI214911 testis          
mKCNQ2         AB000494 genomic      
splice         AB000495 genomic      
variants         AB000496 genomic      
          AB000498 genomic      
          AB000497 genomic      
          AB000499 genomic      
          AB000500 genomic      
          AB000501 genomic      
          AB000502 genomic      
          AB000503 genomic      
rKCNQ2     AF087453 brain AB000504 genomic      
KCNQ3                  
hKCNQ3 AF033347 genomic AI125802 testis AF071478 exon-1 8q24    
      AA001392 retina AF071479 exon-2      
      H08544 infant brain AF071480 exon-3      
      T78692 infant brain AF071481 exon-4      
      R36327 infant brain AF071482 exons 5-6      
      H08545 infant brain AF071483 exon-7      
      H86059 retina AF071484 exon-8      
      R49258 infant brain AF071485 exon-9      
      AA019129 retina AF071486 exon-10      
          AF071487 exon-11      
          AF071488 exon-12      
          AF071489 exon-13      
          AF071490 exon-14      
          AF071491 exon-15      
rKCNQ3 AF087454 brain              
  AF091247 Sym. Gang              
mKCNQ3     AA386747 embryo          
KCNQ4                  
hKCNQ4 AF105202 hair cells     AF105203 exon-1      
          AF105204 exon-2      
          AF105205 exon-3      
          AF105206 exon-4      
          AF105207 exon-5      
          AF105208 exon-6      
          AF105209 exon-7      
          AF105210 exon-8      
          AF105211 exon-9      
          AF105212 exon-10      
          AF105213 exon-11      
          AF105214 exon-12      
          AF105215 exon-13      
          AF105216 exon-14      
Eag-FAMILY-ELEVEN                  
Eag-1                  
hEag1 AF078741 cancer cells         1q32.1-q32.3    
  AJ001366 myoblasts              
  AF078742 cancer cells              
BovEag1 Y13430 photorecept              
  Y13431 photorecept              
rEag1 Z34264 cerebellum              
  AF073891 symp ganglia              
mEag1 U04294 brain              
Eag-2                  
rEag2 AF073891 symp ganglia              
ERG-FAMILY-TWELVE                  
Erg1                  
h-Erg1 U04270 hippocampus     AB009057 exon-1 7q35-q36    
          AJ010538 exon-2      
          AB009058 exon-2      
          AB009059 exon-3      
          AJ010539 exon-3      
          AJ010540 exon-4      
          AB009060 exon-4      
          AJ010541 exon-5      
          AB009061 exon-5 7    
          AB009062 exon-6      
          AJ010542 exon-6      
          AB009063 exon-7      
          AJ010543 exon-7      
          AJ010544 exon-8      
          AB009064 exon-8      
          AJ010545 exon-9      
          AB009065 exon-9      
          AJ010546 exon-10      
          AB009066 exon-10      
          AJ010547 exon-11      
          AB009067 exon-11      
          AJ010548 exon-12      
          AB009068 exon-12      
          AB009069 exon-13      
          AJ010549 exon-13      
          AB009070 exon-14      
          AJ010550 exon-14      
          AB009071 exon-15      
          AJ010551 exon-15      
mErg1a AF012868 heart     AF012870 exons1-2 5    
mErg1b AF012869 heart     AF012871 exons 3-15      
  AF034762                
rErg1 Z96106 pituitary              
  U75210 heart              
  AF016192 brain              
dogErg1 U75213 heart              
  U87513 ventricle              
rabErg1 U75212 heart              
  AF068736 ventricle              
  AF068734 testis              
  AF068735 ventricle              
gui.pigErg U75211 heart              
Erg2                  
rErg2 AF016191 Sym. Gang              
Erg3                  
hErg3         Z65012        
rErg3 AF016192 Sym. Gang              
dogErg3 AF017429 atrium              
Dro-Erg U36925 brain              
ELK-FAMILY-THIRTEEN                  
Elk-1                  
rElk-1 AF061957 Symp ganglia              
  AJ007632 brain              
Elk-2                  
hEkl-2     U69184 infant brain          
      AI272282 olig--glioma          
rElk-2 AJ007627 cortex              
  AF073892 Symp ganglia              
Elk-3                  
rElk-3 AJ007628 cortex              
SKCa-FAMILY-FOURTEEN                  
SKCa1                  
hSKCa1 U69883 brain F11363 infant brain          
      AA594089 gastric tumor          
      M62043 hippocampus          
      AA350009 infant brain          
      AI363154 brain          
rSKCa1 U69885 brain              
  AF000973 brain              
SKCa2                  
hSKCa2     AA418096 melanocyte          
      AA418000 fetal heart          
rSKCa2 U69882 brain              
mSKCa2     AA288411 liver          
      AA209646 liver          
      AA238176 liver          
SKCa3                  
hSKCa3 AF031815 brain AA767647 ger.ctr B-cell     1q21.3 G16005  
  Y08263 lymphoblasts AA741463 ger.ctr B-cell       AF021127  
      AI201553 prostate          
      AA731772 Tonsil B-cell          
      AA490752 Tonsil B-cell          
      AA256031 Tonsil B-cell          
      AA284005 Tonsil B-cell          
rSKCa3 U69884 brain AI044511 whole rat          
mSKCa3     AI121990 thymus          
IKCA FAMILY FIFTEEN                  
IKCa1                  
hIKCa1 AF033021 placenta N32010 placenta G27747   19q13.2    
  AF000972 placenta N32399 placenta G25625        
  AF022797 T-cells T35001 placenta          
  AF053403 K562 cells T56702 placenta          
  AF022150 ? AA603035 prostate          
      AA652282 prostate          
      AA641296 prostate          
      AI082746 liver          
      AA778857 fetal liver          
      AA703390 fetal liver          
      AA937083 ger.ctr.B-cell          
      AI034286 fibroblast          
      AA424836 ovary          
      AA443903 ovary          
      AA425636 ovary          
      AI081834 testis          
      AA558247 stem cell          
      AA917426 pooled          
      AA076338 pancreas          
      AA076337 pancreas          
      AA122017 pancreas          
      D20860 HL60          
      AA887697 colon          
      T24528 colon          
mIKCa1 AF042487 MEL cell line W99968 embryo          
  AF072884 MEL cell line AA042002 embryo          
      W45910 embryo          
      AA033013 embryo          
      AI413778 embryo          
      W82293 fetus          
      W30402 fetus          
      W79984 fetus          
      AA592555 myotubes          
      AA929133 myotubes          
      AA185547 lymph node          
      AA185916 lymph node          
      AA265296 lymph node          
      AA140298 melanoma          
      AI120925 mammary          
      C86468 fertilized egg          
rIKCa1     AI045731            
SLACK-FAMILY SIXTEEN                  
hSLACK1     R87855 brain          
rSLACK1 AF089730 brain, kidney              
Slo-FAMILY-SEVENTEEN                  
Slo1                  
hSlo1 U13913 Sub. Nigra AI129381 uterus AJ001217   10q22 G10716  
  U11058 myometrium AI147610 uterus       G13610  
  U11717 brain AI095675 uterus          
  AF025999 lens epith AI373399 uterus          
  U23767 vasc. SM AI335943 uterus          
  U02632 fetal Skel. M. AI342342 uterus          
  U09384 hippocampus AI091147 pool          
      AA644503 pool          
      AI276627 pool          
      AA194929 pool          
      R15380 infant brain          
      AI080449 infant brain          
      U48337 pancreas          
      AA070331 neuroepith.          
      AA194930 pool          
      AA412682 testis          
      AI002717 brain          
      AA904544 pool          
      AI367843 pool          
      AA044244 uterus          
      AI263560 pool          
      AA044163 pool          
      AA405034 testis          
      AA412683 testis          
macacaSlo AF026001 lens epith              
PigSlo AF026000 lens epith              
BovSlo U60105 Aortic SM              
DogSlo U41001 Colon SM              
RabSlo AB009312 Skel. Musc              
RatSlo U93052 Aortic SM              
  U55995 myometrium              
  U40603 cortex              
  AF083341 sciatic nerve              
  AF083342 sciatic nerve              
  AF091626 brain              
mSlo L16912 brain              
  U09383 brain              
TurtleSlo AF036625 cochlea              
  AF036626 cochlea              
  AF036627 cochlea              
  AF036628 cochlea              
ChickSlo AF087663 lens epith              
  U23821 cochlea              
  U73189 brain              
  U23823 cochlea              
  AF076268 cochlea              
SLO3                  
humSlo3     T83073 fetal liver          
      T71508 fetal liver          
mSlo3 AF039213 sperm AA072586 macrophage          

Last Updated on 5/28/99
By Jeff Ingeman
Email: jingeman@uci.edu